《漫威蜘蛛侠 2》的支线任务丰富多样，以下是一些主要的支线任务：
1. 好邻居蜘蛛侠7：共有 6 个任务，根据主线剧情推进而逐一解锁。比如 “寻找爷爷” 任务，需与拱门下的女人交谈开始，前往动物园扫描植物找到一本书，再在木凳旁小石柱上扫描另一本书，完成不伤害绿球摧毁红球的谜题，穿过公园找到爷爷。
2. 布鲁克林远见学院6：一共有 5 个任务，完成可解锁 “布鲁克林的骄傲” 奖杯。如 “远见招新集会”，在完成主线任务 “补偿” 后解锁，进入学院与朋友对话，从帐篷后开口进入，蹲在围墙洞位置，躲在木箱后触发过场动画，到任务标记位置击败敌人，将女人带回学院。
3. 圣火8：共 4 个任务，完成可解锁 “猩红时刻” 奖杯及 “救世战衣”。像 “你去哪儿了” 任务，完成主线 “补偿” 后解锁，使用蜘蛛机器人标记被困人员，进入建筑击败敌人。后续还有 “万物皆焚”“我看好你”“天选之人是我” 等任务，需击败敌人、扫描线索、拆除炸弹等。
4. 文化博物馆3：有 2 个任务，完成可解锁 “我的社区” 奖杯。其中一个需扮演迈尔斯，通往犯罪现场，扫描液体触发谜题，进入女人所在大楼后的小巷，击败敌人。
5. 猎人伏击点3：总共有 11 个，位于哈莱姆区、上西区、金融区以及布鲁克林市中心的屋顶上，找到可解锁对应的猎人基地，解锁 “追踪与破坏” 奖杯。
6. 猎人基地3：有 4 个，分别在哈莱姆区、上西区、金融区以及布鲁克林市中心，需击败基地所有敌人并触发蓝色任务标记，完成可获 “追踪与破坏” 奖杯。
7. 共生体巢穴3：共 10 个，分布在哈莱姆区、上东区、上西区、金融区、唐人街、威廉斯堡、小敖德萨、阿斯托里亚等地，消灭所有巢穴可解锁 “害虫终结者” 奖杯。
8. 不明目标3：有 9 个，完成所有任务可解锁 “数据采集专员” 奖杯。
9. EMF 实验4：包含 “小东京：植物科学”“左舷：植物科学”“双桥：植物科学”“中央公园：蜜蜂无人机”“皇后区养蜂厂：蜜蜂无人机”“展望公园：蜜蜂无人机”“中央公园：能源”“布鲁克林高地：能源”“艾米丽・梅基金会” 等多个任务。
10. 徘徊者的储物箱4：包括 “投币式街机”“训练中的徘徊者”“2 对 2”“电波”“布拉克斯顿大厦”“低调”“新生活之屋” 等任务，分布在阿斯托里亚、皇后区市中心、格林尼治村、布鲁克林市中心、中城区、小敖德萨等地，需完成各种解谜和操作来获取奖励。
